Die CMLI setzt sich ein für eine optimale medizinisch-immunologische Labordiagnostik nach Evidenz- und WZW-Kriterien (Wirksamkeit, Zweckmässigkeit und Wirtschaftlichkeit). Sie regelt die Aus-, Weiter- und Fortbildung der FAMH-Titelträger in Medizinischer Immunologie (Spezialist für medizinisch-immunologische Analytik oder Spezialist für Labormedizin, Schwerpunkt Medizinische Immunologie) in Übereinstimmung mit den Richtlinien der FAMH sowie der FMH-Titelträger mit Labor. Ausserdem interessiert sich die CMLI vornehmlich für die Belange der Qualitätssicherung in der medizinisch-immunologischen Labordiagnostik.